El Lucero posee un clima templado que permite el desarrollo de actividades agrícolas y pecuarias. Se identifican dos pisos climáticos: la sábana tropical (con temperaturas entre 18-22°C y una precipitación anual de 1000-1100 mm) y el clima templado húmedo de invierno seco (con temperaturas de 16-18°C y precipitaciones entre 900-1100 mm). La nubosidad promedio es de tipo seminublado, y la humedad relativa anual se aproxima al 81.3%. El régimen de lluvias se concentra de enero a mayo, influenciado por la corriente cálida del océano Pacífico, mientras que el resto del año predomina la corriente fría de Humboldt, generando una estación seca extendida.

El clima de la parroquia no solo define su paisaje, sino que también influye en la salud, la vivienda, la vestimenta y las prácticas productivas de sus habitantes. Frente al cambio climático y fenómenos como El Niño y La Niña, la parroquia cuenta con una estación meteorológica supervisada por el INAMHI, que permite monitorear variables clave para prever riesgos y tomar decisiones sobre energía, agricultura y protección ambiental